CA 125 proizvode mnoge stanice, uključujući stanice karcinoma jajnika. Taj je antigen prisutan u 80% nemucinoznih karcinoma jajnika. CA 125 se prvenstveno koristi za odluke o liječenju karcinoma jajnika, praćenje terapijskog uspjeha te kontrole nakon završenog liječenja. Njegovo povišenje kod osoba s karcinomom jajnika često prati klinički tijek bolesti. Nakon kirurškog liječenja ili kemoterapije njegova razina se podudara s odgovorom na terapiju. Zbog toga je nadmoćan u odnosu na druge tumorske markere kao što je CEA.
CA 125 povišen je i u drugim zloćudnim bolestima uključujući karcinom endometrija, gušterače, dojke, pluća i debelog crijeva te za vrijeme menstruacije, trudnoće, endometrioze i drugih dobroćudnih ginekoloških i neginekoloških stanja. Zbog niske pojavnosti karcinoma jajnika ovaj tumorski marker nije pogodan za dijagnostički probir naoko zdravih osoba.
