Endoskop, instrument s optičkim vlaknima, dug je oko 1.2 m i širok 9-12.5 mm. Optička vlakna poput ogledala omogućuju prijenos slike do oka liječnika te se udružuju u jedinstvenu sliku pomoću složenog sustava leća. Unutar instrumenta nalazi se nekoliko prolaza u koji se mogu umetnuti pomoćni instrumenti kao kliješta, košarice, petlje, četkica za citologiju, laser, kauter i sisaljka. Zrak i voda se također mogu upuhivati kroz instrument čime se omogućuje čišćenje sluznice i njen bolji prikaz. Na glavi ili ručki endoskopa nalaze se dva kontrolna uređaja (˝kotača˝) kojima se upravlja vrhom instrumenta: gore-dolje i lijevo-desno kotač. Glava endoskopa je povezana s posebnim izvorom hladnog svjetla. Dodatna oprema uključuje dodatni pogled za drugog operatera, ultrazvučnu sondu te uređaje za fotografsko i video snimanje.
