Određivanje tumorskih markera obvezan je dio dijagnostičke obrade, tijeka liječenja i praćenja oboljelih od različitih vrsta raka jajnika. Iako se nisu pokazali učinkovitima u ranom otkrivanju bolesti, nezaobilazan su dijagnostički instrument u praćenju i predviđanju preživljenja bolesnica. U svakom slučaju, istraživanja idu dalje, pa su u tijeku brojna istraživanja radi pronalaženja novih krvnih markera koji bi pokazali veću osjetljivost i specifičnost u ranom otkrivanju raka jajnika.
| Markeri | Novotvorine jajnika |
| Estrogeni | Granuloza Stromalni tumori |
| Androgeni | Granuloza Stromalni tumori |
| Testosteron | Androblastom |
| Alphafetoprotein( AFP) | Embrionalni karcinom |
| Endodermalni sinus tumor |
